Как Ubuntu блокирует мой Live USB?

Я замечаю, что после загрузки с моего Live USB (с Ubuntu внутри) и завершения работы, я не смогу загрузить его снова, если я не отсоединяю USB и не подключаю его снова.

Это побочный эффект чего-то, или он преднамерен? Интересно, какой механизм используется для этого?

Вероятно, это связано с некоторыми особенностями вашего BIOS. Определенно не намеренно.