Установить R в моем собственном каталоге

Самый простой способ сделать это – установить R из источника :

 $ wget http://cran.rstudio.com/src/base/R-3/R-3.4.1.tar.gz $ tar xvf R-3.4.1.tar.gz $ cd R-3.4.1 $ ./configure --prefix=$HOME/R $ make && make install 

Второй-последний шаг является критическим. Он настраивает R для установки в подкаталог вашего собственного домашнего каталога.

Чтобы запустить его в Linux, macOS и подобных системах, добавьте $HOME/R/bin в свой PATH . Затем будут выполняться команды оболочки, такие как R и Rscript .

На macOS у вас есть еще одна альтернатива: build R.app и установите ее в папку личных Applications вашего пользователя. Для этого вам нужно установить Xcode.

Вместо этого вы можете вместо этого --prefix=$HOME . Это устанавливает R на верхнем уровне вашего домашнего каталога, так что двоичные файлы R и Rscript заканчиваются в $HOME/bin , что, скорее всего, уже находится в PATH вашего пользователя. Недостатком является то, что он делает более позднюю деинсталляцию сложнее, так как R будет перемешаться между вашим другим содержимым $HOME .

(Если это первое, что вы установили в $HOME/bin , вам, возможно, придется выйти из системы и вернуться в него, чтобы получить это в своем PATH , поскольку он часто добавляется условно, только если $HOME/bin существует во время входа в систему.)

Этот общий шаблон применяется к большому количеству программного обеспечения Unix, которое вы можете установить из исходного кода. Если у программного обеспечения есть скрипт configure , он, вероятно, понимает параметр --prefix , а если нет, обычно существует альтернатива с тем же эффектом.

Эти функции являются общими по ряду причин. В порядке убывания вероятности, по моему опыту:

• Безопасное значение по умолчанию ( /usr/local ) не является правильным $prefix во всех ситуациях. Обстоятельства могут диктовать что-то еще, например /usr , /opt/$PKGNAME и т. Д.

• Системы создания бинарных пакетов ( RPM , DEB , PKG , Cygport …) обычно создают и устанавливают пакет в специальный каталог промежуточного хранения , а затем упаковывают его таким образом, чтобы он расширялся в желаемое место установки.

• Ваш случай, когда вы не можете получить root чтобы установить программное обеспечение в обычное место, поэтому вместо этого вы устанавливаете в $HOME .

Вы также можете использовать приложение-оболочку Renv .

выдержка

Простое управление версиями R: Renv

Renv позволяет легко переключаться между несколькими версиями R. Это просто, ненавязчиво и следует за традициями UNIX для одноцелевых инструментов, которые хорошо справляются.

Ренв делает …

• Позвольте вам изменить глобальную версию R для каждого пользователя.
• Обеспечьте поддержку для каждого проекта R-версий.
• Позвольте вам переопределить версию R с переменной окружения.

Построить из источника с ./configure --prefix=/local/data/project/behi ; make ; make install ./configure --prefix=/local/data/project/behi ; make ; make install

Если вы устанавливаете пакет RPM и он был создан с возможностью перемещения, вы можете использовать

 rpm ... --prefix /local/data/project/behi 

Но не все пакеты построены с помощью перемещаемых двоичных файлов, и я не думаю, что пакеты debian имеют этот параметр (хотя вы можете преуспеть в dpkg --instdir ).