Tag: память

объединить несколько файлов на основе первого столбца и сохранить проблемы с памятью

У меня есть несколько файлов fastq с разделителями табуляции. Я хочу совместить вторую строку каждого чтения и добавлять значения рядом с ним, если они совпадают. например: file1.fq >1 ATGCCGTT file1:1 + HHHHKKKK file2.fq >2 ATGCCGTT file2:3 + JJKHHTTT >3 ATTCCAAC file2:1 + =#GJLMNB Результат, который я хочу, похож: output.txt ATGCCGTT file1:1 file2:3 count:4 ATTCCAAC file2:1 […]

FDT, перемещенный U-Boot, не может быть доступен Linux (в highmem)

Мы запускаем настраиваемую версию U-Boot на встроенной системе на основе ARM и хотели бы загрузить Linux 4.3 с помощью блочного дерева устройств. В системе имеется 1 ГБ оперативной памяти, из которых верхние 128 МБ зарезервированы для постоянного хранения. Я использую tftp для копирования ядра и DTB в определенные ячейки памяти (ядро: 0x02000000, DTB: 0x02400000), и […]

VmHWM только 25%, тогда как это должно быть около 80%

У меня есть выделенный сервер MySQL, оснащенный 128 ГБ оперативной памяти. MySQL недавно убит убийцей oom-killer, хотя MySQL настроен на использование 95 ГБ в худшем случае. В своем исследовании я натолкнулся на это: # cat /proc/11895/status Name: mysqld State: S (sleeping) Tgid: 11895 Pid: 11895 PPid: 24530 TracerPid: 0 Uid: 27 27 27 27 Gid: […]

Ядро: pci 0000: 7f: 12.4: BAR 3: не удалось назначить

Моя хост-машина всегда застряла в последнее время. а иногда и черный экран. И когда я запускаю свою главную машину (CentOS 7.2), она записывает эти данные в /var/log/messages : Журналы находятся ниже: Aug 8 16:29:18 localhost kernel: pci 0000:ff:12.0: BAR 5: failed to assign [mem size 0x00000010] Aug 8 16:29:18 localhost kernel: pci 0000:ff:12.4: BAR 1: […]

Как найти размер страницы физических памятей из пользовательского пространства?

Я хочу понять размер страницы, размер сектора, размер блока (если применимо) флэш-накопителя USB. Есть ли способ проверить меня с Ubuntu? mount /dev/sda1 /mnt ? umount /dev/sda1 редактировать Я заинтересован в написании тестов, которые могли бы обеспечить большее покрытие на стороне хоста. Я хочу протестировать записи размером меньше, равным и большим, чем размер страницы флэш-части и […]

Являются ли ограничения в linux (например, контролируемыми ulimit или /etc/security/limits.conf) для каждого пользователя или для каждого пользователя за процесс?

Я видел три копии процесса, и один из них был создан в виде проблемы с памятью. Каждый индивидуально занимает около 3-4 ГБ памяти. Будет ли ограничение ограничивать убийство одного из них? И если бы это было так, что можно было бы убить?

Если я mmap файл из tmpfs, будет ли он удвоить использование памяти?

Я работаю над системой, в которой мы блокируем файлы в памяти с помощью mmap и MAP_LOCKED и MAP_POPULATE для повышения производительности. Если мы сделаем это с файлом, находящимся в tmpfs, будет ли он использовать существующую область памяти tmpfs или он сделает копию для mmap?

Вызов блокировки памяти в ядрах Linux 2.6.35 и за ее пределами

Эта статья LWN о уплотнении памяти указывает на то, что в ядре linux можно вызвать сжатие памяти Запись номера узла в / proc / sys / vm / compact_node, что приведет к тому, что уплотнение произойдет на указанном узле NUMA. Когда следует записывать номер узла в запись sys? Я имею в виду, что я должен […]

Что кэшируется?

У меня встроенная система с низким объемом памяти. Система имеет проблемы с распределением. Возможно, из-за фрагментации: проблема с распределением памяти на NOMMU? Платформа является платформой NOMMU, поэтому я подозреваю, что кэширование Linux является причиной этой фрагментации. Возможно, это возможно, возможно, это не так. Дело в том, что я не могу понять, что моя система получит […]

Войти в систему

Я запускаю виртуальную машину у провайдера, где вы платите за все, что используете (процессор, память, диск IO, пропускная способность и т. Д.). В настоящее время моя машина имеет 512MB RAM и область подкачки 1GB. Версия ядра – 3.8.0-21, а дистрибутив – Ubuntu 13.04, но я подозреваю, что ядро ​​может быть выполнено на заказ, потому что […]

Linux и Unix - лучшая ОС в мире.