Как распечатать пять самых высоких чисел из столбца?

У меня есть текстовый файл с четырьмя столбцами. Мне нужно прочитать до конца файла и напечатать наибольшее число из столбца3 (верхние 5 значений) вместе с столбцом 1.

input.txt

xm|340034177|ref|RT_235820.1| 139697 192 0 xm|161622288|ref|RT_340093.1| 153819 2607 0 xm|75755638|ref|RT_557407.1| 153821 1937 0 xm|108773031|ref|RT_678101.1| 161452 1688 0 xm|30352011|ref|RT_784766.1| 150568 105 0 

output.txt

 xm|161622288|ref|RT_340093.1| 2607 xm|75755638|ref|RT_557407.1| 1937 xm|108773031|ref|RT_678101.1| 1688 xm|340034177|ref|RT_235820.1| 192 xm|30352011|ref|RT_784766.1| 105 

2 Solutions collect form web for “Как распечатать пять самых высоких чисел из столбца?”

 sort -k3n,3 filename | tail -5 | cut -d " " -f1,6-7 

Вышеуказанная команда будет сортировать файл в третьем поле. Теперь я передаю этот вывод команде tail чтобы напечатать верхние 5 чисел в третьем столбце. Однако, если вам нужен только первый столбец и этот третий столбец на выходе, вы можете вывести команду на выход командой cut .

тестирование

 cat filename T_235820.1| 139697 192 0 xm|161622288|ref|RT_340093.1| 153819 2607 0 xm|75755638|ref|RT_557407.1| 153821 1937 0 xm|108773031|ref|RT_678101.1| 161452 1688 0 xm|30352011|ref|RT_784766.1| 150568 105 0 T_235820.1| 139697 192 0 xm|161622288|ref|RT_340093.1| 153819 607 0 xm|75755638|ref|RT_557407.1| 153821 937 0 xm|108773031|ref|RT_678101.1| 161452 1881 0 xm|30352011|ref|RT_784766.1| 150568 1051 0 

Теперь я запускаю указанную выше команду в этом файле.

 sort -k3n,3 filename | tail -5 | cut -d " " -f1,6-7 

Результат, который я получаю,

 xm|30352011|ref|RT_784766.1| 1051 xm|108773031|ref|RT_678101.1| 1688 xm|108773031|ref|RT_678101.1| 1881 xm|75755638|ref|RT_557407.1| 1937 xm|161622288|ref|RT_340093.1| 2607 

РЕДАКТИРОВАТЬ

Вы можете добавить флаг -g для чисел с плавающей запятой и отрицательных чисел, если у вас есть файл. Команда будет выглядеть так:

 sort -k3ng,3 filename | tail -5 | cut -d " " -f1,6-7 

Вы можете отсортировать файл перед его обработкой с помощью awk :

 $ sort -rnk3 file | awk 'FNR < 6 {print $1,$3}' OFS="\t" xm|161622288|ref|RT_340093.1| 2607 xm|75755638|ref|RT_557407.1| 1937 xm|108773031|ref|RT_678101.1| 1688 xm|340034177|ref|RT_235820.1| 192 xm|30352011|ref|RT_784766.1| 105 

Или вы можете использовать perl самостоятельно для выполнения задания:

 $ perl -anle ' push @a, [$F[0],$F[2]]; END { $" = "\t"; print "@$_" for (sort { $b->[1] <=> $a->[1] } @a)[0..4]; } ' file xm|161622288|ref|RT_340093.1| 2607 xm|75755638|ref|RT_557407.1| 1937 xm|108773031|ref|RT_678101.1| 1688 xm|340034177|ref|RT_235820.1| 192 xm|30352011|ref|RT_784766.1| 105 
  • сортировать файл по длине столбца / строки
  • Поиск файлов, содержащих строку, и список их имен, отсортированных по дате изменения
  • Сортировка по дате
  • Различные результаты OS X / Linux с «find PATH -mount \ (-type f -o-type d \) -print0 | LC_ALL = C sort --zero-terminated> OUTPUT.txt "
  • Каков порядок сортировки при использовании условных операторов?
  • линии с уникальной контрольной суммой
  • Процессы печати, отсортированные по использованию ЦП
  • Сценарий для отображения количества файлов (по типу файлов) в каталоге?
  • Как показать время процессора для процессов через вершину без «корневых» процессов
  • Ограничение размера файла превышено в bash
  • Как сделать обратный вывод, который уже передан из команд сортировки и вырезания
  • Interesting Posts
    Linux и Unix - лучшая ОС в мире.